Japanin aivokuume on virustauti, joka aiheutuu flaviviruksiin kuuluvasta Japanin aivokuumeviruksesta (Japanese encephalitis virus, JEV). Tauti on endeeminen Aasian ja Tyynenmeren alueella, ja se voi aiheuttaa vakavia neurologisia komplikaatioita, erityisesti lapsilla. Japanin aivokuumeen aiheuttama tulehdus voi johtaa aivokudoksen